Участник:Tiy
Материал из MachineLearning.
(→Кратко) |
|||
| (19 промежуточных версий не показаны.) | |||
| Строка 1: | Строка 1: | ||
| + | == Кратко == | ||
| + | Торшин Иван Юрьевич (р. 1972), к.ф.-м.н., к.х.н., доцент МФТИ. 205 публикаций в реферируемых журналах по информатике, прикладной математике, биомедицине, биоинформатике, биофизике и химии; 3 монографии в серии “Bioinformatics in Post-genomic Era» (Nova Biomedical Publishers, NY, 2006-2009). | ||
| + | == Список научных интересов == | ||
| - | + | *"Метрические" и "бинарные" подходы к постановке и решению плохо-формализованных задач | |
| + | *Порождение проблемно-ориентированных метрик и анализ метрических конфигураций | ||
| + | *Комбинаторная теория разрешимости | ||
| + | *Теория классификации значений признаков | ||
| + | *Теория графов и её комбинаторные приложения в хемоинформатике | ||
| + | *Интеллектуальный анализ данных биомедицинских исследований | ||
| + | *Комплекс задач из области биоинформатики | ||
| + | |||
| + | == Примеры задач, которые могут быть предложены в качестве бакалаврской/магистерской работы == | ||
| + | |||
| + | *«Размывание» корреляций по уровням иерархии биологических систем | ||
| + | *Общая теория алгоритмов выравнивания символьных последовательностей | ||
| + | *Распознавание гена (распознавание промотеров, распознавание сайтов сплайсинга,распознавание экзонов) | ||
| + | *1D→3D: задача распознавания класса пространственной структуры белка | ||
| + | *1D→Ф — задача аннотации генома | ||
| + | *Формула→3Dл | ||
| + | *Сравнение химических формул | ||
| + | *"Циклический" отбор признаков в генетических ассоциациях | ||
| + | *Концептуализация абстрактов публикаций с использованием онтологий терминов | ||
| + | *... | ||
| + | |||
| + | |||
| + | "Цели" и "идеи" этих и других задач объясняются в курсе лекций | ||
| + | |||
| + | == Ссылка на программу курса лекций == | ||
| + | |||
| + | |||
| + | [[%D0%91%D0%B8%D0%BE%D0%B8%D0%BD%D1%84%D0%BE%D1%80%D0%BC%D0%B0%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_%D0%B8_%D0%B7%D0%B0%D0%B4%D0%B0%D1%87%D0%B8_%D1%80%D0%B0%D1%81%D0%BF%D0%BE%D0%B7%D0%BD%D0%B0%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D1%8F_%D0%B2_%D1%81%D0%BE%D0%B2%D1%80%D0%B5%D0%BC%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D0%BE%D0%B9_%D0%B1%D0%B8%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D0%B8%D0%B8_%28%D0%BA%D1%83%D1%80%D1%81_%D0%BB%D0%B5%D0%BA%D1%86%D0%B8%D0%B9%2C_%D0%98.%D0%AE._%D0%A2%D0%BE%D1%80%D1%88%D0%B8%D0%BD%29]] | ||
| + | |||
| + | == Публикации == | ||
| + | |||
| + | '''По целям и задачам современной биоинформатики:''' | ||
| + | |||
| + | Torshin I.Yu. Sensing the change from molecular genetics to personalized medicine. Nova Biomedical Books, NY, USA, 2009, In “Bioinformatics in the Post-Genomic Era” series, ISBN 1-60692-217-0. | ||
| + | |||
| + | Torshin I.Yu. Bioinformatics in the post-genomic era: physiology and medicine. Nova Biomedical Books, NY, USA (2007), ISBN 1-60021-752-4. | ||
| + | |||
| + | Torshin I.Yu. Bioinformatics in the Post-Genomic Era: The Role of Biophysics, 2006, Nova Biomedical Books, NY, ISBN 1-60021-048-1. | ||
| + | |||
| + | '''О плохо-формализованных задачах:''' | ||
| + | |||
| + | Torshin I. Yu. Optimal Dictionaries of the Final Information on the Basis of the Solvability Criterion and Their Applications in Bioinformatics. Pattern Recognition and Image Analysis, 2013, Vol. 23, No. 2, pp. 319–327. © Pleiades Publishing. DOI: 10.1134/S1054661813020156. ISSN 1054-6618. | ||
| + | |||
| + | '''О комбинаторной теории разрешимости:''' | ||
| + | |||
| + | Рудаков К.В., Торшин И.Ю. Об отборе информативных значений признаков на базе критериев разрешимости в задаче распознавания вторичной структуры белка. Доклады Академии наук. 2011. Т. 441. № 1. С. 24-28. | ||
| + | |||
| + | '''Об использовании критерия регулярности (по Ю.И.Журавлёву) при анализе плохо-формализованных задач:''' | ||
| + | |||
| + | Журавлёв Ю.И., Рудаков К.В., Торшин И.Ю. Алгебраические критерии локальной разрешимости и регулярности как инструмент исследования морфологии аминокислотных последовательностей. Труды Московского физико-технического института. 2011. Т. 3. № 4. С. 45-54. | ||
Текущая версия
Содержание |
Кратко
Торшин Иван Юрьевич (р. 1972), к.ф.-м.н., к.х.н., доцент МФТИ. 205 публикаций в реферируемых журналах по информатике, прикладной математике, биомедицине, биоинформатике, биофизике и химии; 3 монографии в серии “Bioinformatics in Post-genomic Era» (Nova Biomedical Publishers, NY, 2006-2009).
Список научных интересов
- "Метрические" и "бинарные" подходы к постановке и решению плохо-формализованных задач
- Порождение проблемно-ориентированных метрик и анализ метрических конфигураций
- Комбинаторная теория разрешимости
- Теория классификации значений признаков
- Теория графов и её комбинаторные приложения в хемоинформатике
- Интеллектуальный анализ данных биомедицинских исследований
- Комплекс задач из области биоинформатики
Примеры задач, которые могут быть предложены в качестве бакалаврской/магистерской работы
- «Размывание» корреляций по уровням иерархии биологических систем
- Общая теория алгоритмов выравнивания символьных последовательностей
- Распознавание гена (распознавание промотеров, распознавание сайтов сплайсинга,распознавание экзонов)
- 1D→3D: задача распознавания класса пространственной структуры белка
- 1D→Ф — задача аннотации генома
- Формула→3Dл
- Сравнение химических формул
- "Циклический" отбор признаков в генетических ассоциациях
- Концептуализация абстрактов публикаций с использованием онтологий терминов
- ...
"Цели" и "идеи" этих и других задач объясняются в курсе лекций
Ссылка на программу курса лекций
Биоинформатика_и_задачи_распознавания_в_современной_биологии_(курс_лекций,_И.Ю._Торшин)
Публикации
По целям и задачам современной биоинформатики:
Torshin I.Yu. Sensing the change from molecular genetics to personalized medicine. Nova Biomedical Books, NY, USA, 2009, In “Bioinformatics in the Post-Genomic Era” series, ISBN 1-60692-217-0.
Torshin I.Yu. Bioinformatics in the post-genomic era: physiology and medicine. Nova Biomedical Books, NY, USA (2007), ISBN 1-60021-752-4.
Torshin I.Yu. Bioinformatics in the Post-Genomic Era: The Role of Biophysics, 2006, Nova Biomedical Books, NY, ISBN 1-60021-048-1.
О плохо-формализованных задачах:
Torshin I. Yu. Optimal Dictionaries of the Final Information on the Basis of the Solvability Criterion and Their Applications in Bioinformatics. Pattern Recognition and Image Analysis, 2013, Vol. 23, No. 2, pp. 319–327. © Pleiades Publishing. DOI: 10.1134/S1054661813020156. ISSN 1054-6618.
О комбинаторной теории разрешимости:
Рудаков К.В., Торшин И.Ю. Об отборе информативных значений признаков на базе критериев разрешимости в задаче распознавания вторичной структуры белка. Доклады Академии наук. 2011. Т. 441. № 1. С. 24-28.
Об использовании критерия регулярности (по Ю.И.Журавлёву) при анализе плохо-формализованных задач:
Журавлёв Ю.И., Рудаков К.В., Торшин И.Ю. Алгебраические критерии локальной разрешимости и регулярности как инструмент исследования морфологии аминокислотных последовательностей. Труды Московского физико-технического института. 2011. Т. 3. № 4. С. 45-54.
