Графические модели (курс лекций)/2013/Задание 3

Материал из MachineLearning.

(Различия между версиями)
Перейти к: навигация, поиск
(Модель авторегрессии)
м (Формулировка задания)
 
(22 промежуточные версии не показаны)
Строка 1: Строка 1:
{{main|Графические модели (курс лекций)}}
{{main|Графические модели (курс лекций)}}
-
{{stop|Формулировка задания находится в стадии подготовки. Убедительная просьба не приступать к выполнению задания до тех пор, пока это предупреждение не будет удалено.}}
+
{{TOCright|300px}}
-
'''Начало выполнения задания''': 18 марта 2013 г.;<br>
+
{|
-
'''Срок сдачи''': {{ins|7 апреля 2013 г. (воскресенье), 23:59.}}
+
|[[Изображение:GM13_task3_intro.png|мини|300px|Пример сегментации сигнала, сгенерированного из авторегрессионной скрытой марковской модели с 3-мя состояниями и глубиной авторегрессии 2.]]
 +
|}
 +
 
 +
'''Начало выполнения задания''': 1 апреля 2013 г.;<br>
 +
'''Срок сдачи''': {{ins|11 апреля 2013 г. (четверг), 23:59.}}
Среда для выполнения задания — MATLAB. Неэффективная реализация кода может негативно отразиться на оценке.
Среда для выполнения задания — MATLAB. Неэффективная реализация кода может негативно отразиться на оценке.
Строка 16: Строка 20:
:<tex>\vec{x}_n = \vec{w} + A\vec{x}_{n-1} + \vec{\varepsilon}_n,\quad \vec{\varepsilon}_n\sim\mathcal{N}(\vec{0},\Sigma)</tex>.
:<tex>\vec{x}_n = \vec{w} + A\vec{x}_{n-1} + \vec{\varepsilon}_n,\quad \vec{\varepsilon}_n\sim\mathcal{N}(\vec{0},\Sigma)</tex>.
-
Здесь <tex>\vec{w}\in\mathbb{R}^d</tex> — параметр сдвига, <tex>A\in\mathbb{R}^{d\times d}</tex> — авторегрессионная матрица, <tex>\Sigma\in\mathbb{R}^{d\times d}</tex> — матрица ковариации шума, шумовые компоненты <tex>\vec{\varepsilon}_n</tex> предполагаются независимыми. Процесс авторегрессии является стационарным, если все собственные значения матрицы <tex>A</tex> (включая комплексные) по модулю меньше единицы. Мат.ожидание <tex>\vec{\mu}</tex> стационарного процесса авторегрессии определяется как
+
Здесь <tex>\vec{w}\in\mathbb{R}^d</tex> — параметр сдвига, <tex>A\in\mathbb{R}^{d\times d}</tex> — авторегрессионная матрица, <tex>\Sigma\in\mathbb{R}^{d\times d}</tex> — матрица ковариации шума, шумовые компоненты <tex>\vec{\varepsilon}_n</tex> предполагаются независимыми. Процесс авторегрессии является стационарным (в широком смысле), если все собственные значения матрицы <tex>A</tex> (включая комплексные) по модулю меньше единицы. Мат.ожидание <tex>\vec{\mu}</tex> стационарного процесса авторегрессии определяется как
:<tex>\vec{\mu} = (I-A)^{-1}\vec{w}</tex>,
:<tex>\vec{\mu} = (I-A)^{-1}\vec{w}</tex>,
Строка 32: Строка 36:
:<tex>\vec{x}_n = \vec{w}+\sum_{m=1}^MA_m\vec{x}_{n-m}+ \vec{\varepsilon}_n,\quad \vec{\varepsilon}_n\sim\mathcal{N}(\vec{0},\Sigma)</tex>.
:<tex>\vec{x}_n = \vec{w}+\sum_{m=1}^MA_m\vec{x}_{n-m}+ \vec{\varepsilon}_n,\quad \vec{\varepsilon}_n\sim\mathcal{N}(\vec{0},\Sigma)</tex>.
-
Здесь шумовые компоненты <tex>\vec{\varepsilon}_n</tex> по-прежнему предполагаются независимыми. Очевидно, что авторегрессия M-го порядка может быть сведена к авторегрессии первого порядка как
+
Здесь шумовые компоненты <tex>\vec{\varepsilon}_n</tex> по-прежнему предполагаются независимыми. Авторегрессия M-го порядка может быть сведена к авторегрессии первого порядка как
-
:<tex>\tilde{\vec{x}}_n = \tilde{\vec{w}} + \tilde{A}\tilde{\vec{x}}_{n-1} + \tilde{\vec{\varepsilon}}_n,\quad \tilde{\vec{w}} = \begin{bmatrix}\vec{w}\\ 0\\ \vdots \\ 0\end{bmatrix},\quad \tilde{\vec{x}}_n = \begin{bmatrix}\vec{x}_n\\ \vec{x}_{n-1}\\ \vdots \\ \vec{x}_{n-M}\end{bmatrix},\quad \tilde{A} = \begin{bmatrix}A_1 & A_2 & A_3 & \dots & A_{M-1} & A_M\\ I & 0 & 0 & \dots & 0 & 0\\ 0 & I & 0 & \dots & 0 & 0\\ \dots \\ 0 & 0 & 0 & \dots & I & 0 \end{bmatrix},\quad \tilde{\vec{\varepsilon}}_n = \begin{bmatrix}\vec{\varepsilon}_n \\ 0 \\ \vdots \\ 0\end{bmatrix}.</tex>
+
:<tex>\tilde{\vec{x}}_n = \tilde{\vec{w}} + \tilde{A}\tilde{\vec{x}}_{n-1} + \tilde{\vec{\varepsilon}}_n,\quad \tilde{\vec{x}}_n = \begin{bmatrix}\vec{x}_n\\ \vec{x}_{n-1}\\ \vdots \\ \vec{x}_{n-M}\end{bmatrix},\quad \tilde{\vec{w}} = \begin{bmatrix}\vec{w}\\ 0\\ \vdots \\ 0\end{bmatrix},\quad \tilde{A} = \begin{bmatrix}A_1 & A_2 & A_3 & \dots & A_{M-1} & A_M\\ I & 0 & 0 & \dots & 0 & 0\\ 0 & I & 0 & \dots & 0 & 0\\ \dots \\ 0 & 0 & 0 & \dots & I & 0 \end{bmatrix},\quad \tilde{\vec{\varepsilon}}_n = \begin{bmatrix}\vec{\varepsilon}_n \\ 0 \\ \vdots \\ 0\end{bmatrix}.</tex>
-
Поэтому авторегрессия M-го порядка является стационарной, если все собственные значения матрицы <tex>\tilde{A}</tex> по модулю меньше единицы. Мат.ожидание стационарной регрессии M-го порядка определяется как
+
Поэтому авторегрессия M-го порядка является стационарной, когда все собственные значения матрицы <tex>\tilde{A}</tex> по модулю меньше единицы. В частности, для случая <tex>d=1,M=1</tex> условие стационарности эквивалентно <tex>|A_1|<1</tex>, а для случая <tex>d=1,M=2</tex> — условию <tex>|A_1|<2,\ -1<A_2<1-|A_1|</tex>. Мат.ожидание стационарной регрессии M-го порядка определяется как
:<tex>\vec{\mu} = (I-A_1-\dots-A_M)^{-1}\vec{w}</tex>.
:<tex>\vec{\mu} = (I-A_1-\dots-A_M)^{-1}\vec{w}</tex>.
Строка 50: Строка 54:
а <tex>X_0=\{\vec{x}_0,\vec{x}_{-1},\dots,\vec{x}_{1-M}\}</tex> — начальная предыстория.
а <tex>X_0=\{\vec{x}_0,\vec{x}_{-1},\dots,\vec{x}_{1-M}\}</tex> — начальная предыстория.
-
Одним из способов исследования адекватности моделирования данных с помощью модели авторегрессии является исследование остатков
+
[[Изображение:ACF.png|thumb|300px|Пример выборочной автокорреляционной функции с отсутствием значимых автокорреляций]]
 +
 
 +
Одним из способов определения адекватности моделирования данных с помощью модели авторегрессии является исследование остатков
:<tex>\hat{\varepsilon}_n = \vec{x}_n - \hat{\vec{w}} - \sum_{m=1}^M\hat{A}_m\vec{x}_{n-m}</tex>,
:<tex>\hat{\varepsilon}_n = \vec{x}_n - \hat{\vec{w}} - \sum_{m=1}^M\hat{A}_m\vec{x}_{n-m}</tex>,
-
где <tex>\hat{\vec{w}},\hat{A}</tex> — оценки параметров авторегрессии (например, оценки максимального правдоподобия). Для успешного объяснения данных с помощью авторегрессии необходимо, чтобы остатки не были коррелированы по времени. Другими словами, автокорреляционная функция
+
где <tex>\hat{\vec{w}},\hat{A}</tex> — оценки параметров авторегрессии (например, оценки максимального правдоподобия). Для успешного объяснения данных с помощью авторегрессии необходимо, чтобы остатки не были коррелированы по времени. Другими словами, выборочная автокорреляционная функция
 +
 
 +
:<tex>ACF(\tau) = c_{\tau}/c_0,\quad c_{\tau} = \frac{1}{N-\tau}\sum_{n = \tau+1}^N(\varepsilon_n - \bar{\varepsilon})(\varepsilon_{n-\tau} - \bar{\varepsilon}),\quad \bar{\varepsilon} = \frac{1}{N}\sum_n\varepsilon_n</tex>
-
:<tex>ACF(\tau) = c_{\tau}/c_0,\quad c_{\tau} = \frac{1}{N-\tau}\sum_{n = \tau+1}^N(\varepsilon_n - \mu)(\varepsilon_{n-\tau} - \mu),\quad \mu = \frac{1}{N}\sum_n\varepsilon_n</tex>
+
должна лежать в интервале <tex>\pm \frac{z_{1-\alpha/2}}{\sqrt{N}}</tex> для всех <tex>\tau</tex>. Здесь через <tex>z_{\beta}</tex> обозначена <tex>\beta</tex>-квантиль одномерного нормального распределения. Для уровня значимости <tex>\alpha=0.05</tex> соответствующая квантиль равна 1.96.
== Авторегрессионная скрытая марковская модель ==
== Авторегрессионная скрытая марковская модель ==
Строка 64: Строка 72:
''Авторегрессионная скрытая марковская модель M-го порядка'' — это байесовская сеть, граф которой показан на рис. справа, а совместное распределение задается как
''Авторегрессионная скрытая марковская модель M-го порядка'' — это байесовская сеть, граф которой показан на рис. справа, а совместное распределение задается как
-
:<tex>p(X,T|\theta,X_0)=p(t_1)\prod_{n=2}^Np(t_n |t_{n-1})\prod_{n=1}^Np(\vec{x}_n |t_n,\vec{x}_{n-1},\dots,\vec{x}_{n-M})</tex>.
+
:<tex>p(X,T|\Theta,X_0)=p(t_1)\prod_{n=2}^Np(t_n |t_{n-1})\prod_{n=1}^Np(\vec{x}_n |t_n,\vec{x}_{n-1},\dots,\vec{x}_{n-M})</tex>.
Здесь <tex>t_n\in\{1,\dots,K\}</tex> — скрытые дискретные состояния, <tex>\vec{x}_n\in\mathbb{R}^d</tex> — непрерывные наблюдаемые переменные. Априорное распределение <tex>p(t_1)</tex> задается вектором <tex>[\pi_1,\ldots,\pi_K]</tex>, причем все <tex>\pi_k\ge 0</tex> и <tex>\sum_k\pi_k=1</tex>. Распределение <tex>p(t_n |t_{n-1})</tex> задается матрицей перехода <tex>R</tex> размера <tex>K\times K</tex>, где в <tex>ij</tex>-ой позиции стоит вероятность перехода из состояния <tex>i</tex> в состояние <tex>j</tex>. Все элементы этой матрицы неотрицательны, а сумма элементов по каждой строке равна единице. Модель генерации данных соответствует модели авторегрессии, в которой параметры <tex>\vec{w},\mathcal{A},\Sigma</tex> зависят от текущего состояния <tex>t_n</tex>. Таким образом,
Здесь <tex>t_n\in\{1,\dots,K\}</tex> — скрытые дискретные состояния, <tex>\vec{x}_n\in\mathbb{R}^d</tex> — непрерывные наблюдаемые переменные. Априорное распределение <tex>p(t_1)</tex> задается вектором <tex>[\pi_1,\ldots,\pi_K]</tex>, причем все <tex>\pi_k\ge 0</tex> и <tex>\sum_k\pi_k=1</tex>. Распределение <tex>p(t_n |t_{n-1})</tex> задается матрицей перехода <tex>R</tex> размера <tex>K\times K</tex>, где в <tex>ij</tex>-ой позиции стоит вероятность перехода из состояния <tex>i</tex> в состояние <tex>j</tex>. Все элементы этой матрицы неотрицательны, а сумма элементов по каждой строке равна единице. Модель генерации данных соответствует модели авторегрессии, в которой параметры <tex>\vec{w},\mathcal{A},\Sigma</tex> зависят от текущего состояния <tex>t_n</tex>. Таким образом,
Строка 70: Строка 78:
:<tex>p(\vec{x}_n|t_n,\vec{x}_{n-1},\dots,\vec{x}_{n-M})=\mathcal{N}(\vec{x}_n|\vec{w}_{t_n}+\sum_{m=1}^MA_{m,t_n}\vec{x}_{n-m},\Sigma_{t_n})</tex>.
:<tex>p(\vec{x}_n|t_n,\vec{x}_{n-1},\dots,\vec{x}_{n-M})=\mathcal{N}(\vec{x}_n|\vec{w}_{t_n}+\sum_{m=1}^MA_{m,t_n}\vec{x}_{n-m},\Sigma_{t_n})</tex>.
-
В результате полный набор параметров модели состоит из <tex>\vec{\pi},R,\{\vec{w}_k,\mathcal{A}_k,\Sigma_k\}_{k=1}^K</tex>. Глубина авторегрессии <tex>M</tex>, количество скрытых состояний <tex>K</tex>, а также начальная предыстория <tex>X_0=\{\vec{x}_0,\vec{x}_{-1},\dots,\vec{x}_{1-M}\}</tex> задаются пользователем.
+
В результате полный набор параметров модели <tex>\Theta</tex> состоит из <tex>\vec{\pi},R,\{\vec{w}_k,\mathcal{A}_k,\Sigma_k\}_{k=1}^K</tex>. Глубина авторегрессии <tex>M</tex>, количество скрытых состояний <tex>K</tex>, а также начальная предыстория <tex>X_0=\{\vec{x}_0,\vec{x}_{-1},\dots,\vec{x}_{1-M}\}</tex> задаются пользователем.
== Формулировка задания ==
== Формулировка задания ==
Строка 78: Строка 86:
#* Реализовать процедуру генерации сигнала из модели авторегрессии;
#* Реализовать процедуру генерации сигнала из модели авторегрессии;
#* Реализовать процедуру оценки параметров <tex>\vec{w},\mathcal{A},\Sigma</tex> по методу максимального правдоподобия;
#* Реализовать процедуру оценки параметров <tex>\vec{w},\mathcal{A},\Sigma</tex> по методу максимального правдоподобия;
-
#* Реализовать процедуру оценки выборочной автокорреляционной функции остатков авторегрессии;
+
# Провести эксперименты с авторегрессией M-го порядка:
-
# Провести эксперименты с авторегрессией M-го порядка на модельных данных:
+
#* Сгенерировать данные из модели авторегрессии, а затем восстановить параметры по методу максимального правдоподобия (рассмотреть различные значения параметров модели, а также различные размерности параметров). Как ведут себя значение правдоподобия, авторегрессионные остатки и восстановленные параметры при глубине авторегрессии меньше истинного значения, равного истинному значению и больше истинного значения? Какой объем данных необходим для адекватного восстановления параметров модели?
-
#* в
+
#* Сгенерировать данные из модели случайного процесса, отличного от авторегрессии. К чему приводит попытка объяснения таких данных с помощью авторегрессии?
# Для авторегрессионной скрытой марковской модели:
# Для авторегрессионной скрытой марковской модели:
-
#* Вывести формулы ЕМ-алгоритма для оценки параметров модели <tex>\vec{\pi},R,\{\vec{w}_k,\mathcal{A}_k,\Sigma_k}_{k=1}^K</tex>, при этом предусмотреть ситуации, когда часть параметров известна;
+
#* Вывести формулы ЕМ-алгоритма для оценки параметров модели <tex>\vec{\pi},R,\{\vec{w}_k,\mathcal{A}_k,\Sigma_k}_{k=1}^K</tex>, при этом предусмотреть ситуации, когда часть параметров задается пользователем;
#* Реализовать процедуру генерации сигнала из модели;
#* Реализовать процедуру генерации сигнала из модели;
-
#* Реализовать процедуру оценки параметров модели с помощью EM-алгоритма;
+
#* Реализовать процедуру вычисления маргинальных распределений для отдельных скрытых переменных <tex>t_n</tex> и пар соседних переменных <tex>t_{n-1},t_n</tex> при известных наблюдениях и параметрах модели с помощью алгоритма «вперёд-назад»;
-
#* Реализовать процедуру оценки скрытых состояний по наблюдаемым данным и параметрам модели с помощью алгоритма Витерби;
+
#* Реализовать процедуру оценки параметров модели по методу максимального правдоподобия с помощью EM-алгоритма;
-
# Провести эксперименты с авторегрессионной скрытой марковской моделью на модельных данных:
+
#* Реализовать процедуру поиска наиболее вероятной конфигурации скрытых переменных по наблюдаемым данным и параметрам модели с помощью алгоритма Витерби;
-
# Применить авторегрессионную скрытую марковскую модель для моделирования и сегментации движений в базе данных mocap.
+
# Провести эксперименты с авторегрессионной скрытой марковской моделью:
 +
#* Сгенерировать наблюдаемые и скрытые переменные из модели, а затем восстановить скрытые компоненты с помощью алгоритма Витерби при истинных параметрах модели, а также путем взятия аргмаксимумов для маргинальных распределений на <tex>t_n</tex>. Рассмотреть ситуации хорошо отделимых и слабо отделимых состояний, а также различные размерности параметров модели. Привести пример ситуации, когда алгоритм Витерби и аргмаксимумы маргиналов приводят к существенно различным конфигурациям.
 +
#* Сгенерировать наблюдаемые и скрытые переменные из модели, а затем восстановить параметры модели только по наблюдаемым данным с помощью ЕМ-алгоритма. Рассмотреть различные ситуации. Имеет ли смысл в ЕМ-алгоритме задавать часть параметров модели вручную? Как параметры, задаваемые вручную, влияют на значение правдоподобия и на качество сегментации сигнала?
 +
# '''[Бонус]''' Предложить свою схему сегментации подмножества сигналов, сгенерированных из авторегрессионной скрытой марковской модели, без использования модели авторегрессии.
 +
# Составить отчёт в формате PDF с описанием всех проведённых исследований. Данный отчёт должен включать в себя вывод необходимых формул, различные графики с результатами экспериментов, а также развернутые комментарии к полученным результатам.
== Рекомендации по выполнению задания ==
== Рекомендации по выполнению задания ==
Строка 97: Строка 109:
После вывода необходимых формул рекомендуется убедиться в том, что эти формулы переходят в стандартные формулы для оценки параметров многомерного нормального распределения (в том числе в рамках скрытой марковской модели) при обнулении всех A.
После вывода необходимых формул рекомендуется убедиться в том, что эти формулы переходят в стандартные формулы для оценки параметров многомерного нормального распределения (в том числе в рамках скрытой марковской модели) при обнулении всех A.
-
2. При тестировании ЕМ-алгоритма рекомендуется отслеживать монотонное возрастание логарифма неполного правдоподобия в итерациях.
+
В случае вывода формул для <tex>\vec{w}</tex> при известном <tex>\mathcal{A}</tex> или, наоборот, формул для <tex>\mathcal{A}</tex> при фиксированном <tex>\vec{w}</tex> нотация через <tex>B,\vec{y}_n</tex> не подходит.
 +
 
 +
2. При тестировании ЕМ-алгоритма рекомендуется отслеживать монотонное возрастание логарифма неполного правдоподобия в итерациях. При этом вблизи локального максимума правдоподобия возможны небольшие нарушения монотонности из-за вычислительных погрешностей.
 +
 
 +
3. Обратите внимание, что для возможности реализации в сигналах сегментов типа <tex>k</tex> некоторой длины <tex>N_e</tex> необходимо, чтобы величина <tex>R_{kk}^{N_e}</tex> была существенно отлична от нуля.
== Оформление задания ==
== Оформление задания ==
Строка 104: Строка 120:
Присланный вариант задания должен содержать в себе:
Присланный вариант задания должен содержать в себе:
-
* Файл отчёта в формате PDF с указанием ФИО.
+
* Файл отчёта в формате PDF с указанием ФИО;
* Все исходные коды с необходимыми комментариями.
* Все исходные коды с необходимыми комментариями.
Строка 143: Строка 159:
!''Оценка параметров авторегрессии''
!''Оценка параметров авторегрессии''
|-
|-
-
|[w, A, Sigma, res, LH] = '''ar_fit'''(X, M)
+
|[w, A, Sigma, res, logLH] = '''ar_fit'''(X, M)
|-
|-
|ВХОД
|ВХОД
Строка 167: Строка 183:
|res — остатки авторегрессии (набор векторов <tex>\vec{x}_n-\vec{w}-\sum_{m=1}^MA_m\vec{x}_{n-m}</tex>), матрица размера (N-M) x d;
|res — остатки авторегрессии (набор векторов <tex>\vec{x}_n-\vec{w}-\sum_{m=1}^MA_m\vec{x}_{n-m}</tex>), матрица размера (N-M) x d;
|-
|-
-
|LH — логарифм правдоподобия настроенной модели авторегрессии, число.
+
|logLH — логарифм правдоподобия настроенной модели авторегрессии, число.
|}
|}
|}
|}
Строка 194: Строка 210:
|Sigmas — матрицы ковариации шума для каждого состояния, массив размера d x d x K;
|Sigmas — матрицы ковариации шума для каждого состояния, массив размера d x d x K;
|-
|-
-
|X0 — начальная предыстория, матрица размера M x d;
+
|X0 — (необязательный параметр) начальная предыстория, матрица размера M x d;
|}
|}
|-
|-
Строка 203: Строка 219:
|X — сгенерированная наблюдаемая последовательность, матрица размера N x d;
|X — сгенерированная наблюдаемая последовательность, матрица размера N x d;
|-
|-
-
|T — сгенерированная последовательность состояния, вектор длины N.
+
|T — сгенерированная последовательность состояний, вектор длины N.
|-
|-
|}
|}
Строка 209: Строка 225:
Если начальная предыстория <tex>X_0</tex> не задана, то <tex>X_0</tex> выбирается равной мат.ожиданию процесса авторегрессии, соответствующего сгенерированному состоянию <tex>t_1</tex>.
Если начальная предыстория <tex>X_0</tex> не задана, то <tex>X_0</tex> выбирается равной мат.ожиданию процесса авторегрессии, соответствующего сгенерированному состоянию <tex>t_1</tex>.
 +
 +
{|class="standard"
 +
!''Оценка маргиналов на скрытые переменные''
 +
|-
 +
|[gamma, ksi, logLH] = '''arhmm_posterior'''(X, p, R, W, A, Sigmas)
 +
|-
 +
|ВХОД
 +
|-
 +
|
 +
{|
 +
|X — наблюдаемая последовательность, матрица размера N x d, первые M строк соответствуют начальной предыстории;
 +
|-
 +
|p — априорное распределение на состояния, вектор длины K;
 +
|-
 +
|R — матрица перехода между состояниями, матрица размера K x K;
 +
|-
 +
|W — параметр сдвига авторегрессий, матрица размера d x K;
 +
|-
 +
|A — авторегрессионные матрицы, массив размера d x Md x K;
 +
|-
 +
|Sigmas — матрицы ковариации шумов, массив размера d x d x K;
 +
|}
 +
|-
 +
|ВЫХОД
 +
|-
 +
|
 +
{|
 +
|gamma — вероятности вида <tex>p(t_n=k|X,\Theta)</tex>, матрица размера K x (N-M);
 +
|-
 +
|ksi — вероятности вида <tex>p(t_{n-1}=k_1,t_n=k_2|X,\Theta)</tex>, массив размера K x K x (N-M-1);
 +
|-
 +
|logLH — логарифм неполного правдоподобия, число.
 +
|}
 +
|}
 +
 +
&nbsp;
{|class="standard"
{|class="standard"
!''Оценка параметров авторегрессионной скрытой марковской модели с помощью ЕМ-алгоритма''
!''Оценка параметров авторегрессионной скрытой марковской модели с помощью ЕМ-алгоритма''
|-
|-
-
|[p, R, W, A, Sigmas] = '''arhmm_fit'''(X, K, M, param_name1, param_value1, ...)
+
|[p, R, W, A, Sigmas, logLH] = '''arhmm_fit'''(X, K, M, param_name1, param_value1, ...)
|-
|-
|ВХОД
|ВХОД
Строка 221: Строка 273:
|X — наблюдаемая последовательность, матрица размера N x d, первые M строк соответствуют начальной предыстории;
|X — наблюдаемая последовательность, матрица размера N x d, первые M строк соответствуют начальной предыстории;
|-
|-
-
|K — количество скрытых состояния, число;
+
|K — количество скрытых состояний, число;
|-
|-
|M — глубина авторегрессии, число;
|M — глубина авторегрессии, число;
Строка 231: Строка 283:
|'max_iter' — максимальное число итераций ЕМ-алгоритма, по умолчанию = 100;
|'max_iter' — максимальное число итераций ЕМ-алгоритма, по умолчанию = 100;
|-
|-
-
|'num_start' — количество запусков из случайных начальных приближений, по умолчанию = 1;
+
|'num_start' — количество запусков из случайных начальных приближений, по умолчанию = 10;
 +
|-
 +
|'tol_LH' — точность оптимизации по значению логарифма правдоподобия, по умолчанию = 1e-4;
|-
|-
-
|'p' — известное априорное распределение на состояния, в случае задания не оптимизируется ЕМ-алгоритмом, по умолчанию = [];
+
|'p' — задаваемое пользователем априорное распределение на состояния (в случае задания не оптимизируется ЕМ-алгоритмом), по умолчанию = [];
|-
|-
-
|'R' — известная матрица перехода между состояниями, в случае задания не оптимизируется ЕМ-алгоритмом, по умолчанию = [];
+
|'R' — задаваемая пользователем матрица перехода между состояниями, по умолчанию = [];
|-
|-
-
|'W' — известный набор параметров сдвига, в случае задания не оптимизируется ЕМ-алгоритмом, по умолчанию = [];
+
|'W' — задаваемый пользователем набор параметров сдвига, по умолчанию = [];
|-
|-
-
|'A' — известный набор авторегрессионных матриц, в случае задания не оптимизируется ЕМ-алгоритмом, по умолчанию = [];
+
|'A' — задаваемый пользователем набор авторегрессионных матриц, по умолчанию = [];
|-
|-
-
|'Sigmas' — известный набор матриц ковариации шума, в случае задания не оптимизируется ЕМ-алгоритмом, по умолчанию = [];
+
|'Sigmas' — задаваемый пользователем набор матриц ковариации шума, по умолчанию = [];
|-
|-
|'display' — режим отображения, true или false, если true, то отображается текущая информация, например, номер запуска, номер итерации, текущее значение правдоподобия и т.д.
|'display' — режим отображения, true или false, если true, то отображается текущая информация, например, номер запуска, номер итерации, текущее значение правдоподобия и т.д.
Строка 250: Строка 304:
|
|
{|
{|
-
|p — априорное распределение на состояние, вектор длины K;
+
|p — априорное распределение на состояния, вектор длины K;
|-
|-
|R — матрица перехода между состояниями, матрица размера K x K;
|R — матрица перехода между состояниями, матрица размера K x K;
Строка 258: Строка 312:
|A — авторегрессионные матрицы, массив размера d x Md x K;
|A — авторегрессионные матрицы, массив размера d x Md x K;
|-
|-
-
|Sigmas — матрицы ковариации шумов, массив размера d x d x K.
+
|Sigmas — матрицы ковариации шумов, массив размера d x d x K;
|-
|-
 +
|logLH — логарифм неполного правдоподобия, число.
|}
|}
|}
|}
Строка 268: Строка 323:
!''Сегментация выборки с помощью алгоритма Витерби''
!''Сегментация выборки с помощью алгоритма Витерби''
|-
|-
-
|T = '''arhmm_segment'''(X, p, R, W, A, Sigmas)
+
|[T, logLH] = '''arhmm_segment'''(X, p, R, W, A, Sigmas)
|-
|-
|ВХОД
|ВХОД
Строка 292: Строка 347:
|
|
{|
{|
-
|T — номера состояний в каждый момент времени, вектор длины N.
+
|T — номера состояний в каждый момент времени, вектор длины N-M;
|-
|-
 +
|logLH — логарифм полного правдоподобия для найденного T, число.
|}
|}
|}
|}
[[Категория:Учебные курсы]]
[[Категория:Учебные курсы]]

Текущая версия

Содержание

Пример сегментации сигнала, сгенерированного из авторегрессионной скрытой марковской модели с 3-мя состояниями и глубиной авторегрессии 2.
Пример сегментации сигнала, сгенерированного из авторегрессионной скрытой марковской модели с 3-мя состояниями и глубиной авторегрессии 2.

Начало выполнения задания: 1 апреля 2013 г.;
Срок сдачи: 11 апреля 2013 г. (четверг), 23:59.

Среда для выполнения задания — MATLAB. Неэффективная реализация кода может негативно отразиться на оценке.

Модель авторегрессии

Графическая модель авторегрессии 1-го порядка
Графическая модель авторегрессии 1-го порядка

Случайный процесс с дискретным временем \{\vec{x}_n\}_{n=1}^N, \vec{x}_n\in\mathbb{R}^d называется авторегрессией первого порядка, если

\vec{x}_n = \vec{w} + A\vec{x}_{n-1} + \vec{\varepsilon}_n,\quad \vec{\varepsilon}_n\sim\mathcal{N}(\vec{0},\Sigma).

Здесь \vec{w}\in\mathbb{R}^d — параметр сдвига, A\in\mathbb{R}^{d\times d} — авторегрессионная матрица, \Sigma\in\mathbb{R}^{d\times d} — матрица ковариации шума, шумовые компоненты \vec{\varepsilon}_n предполагаются независимыми. Процесс авторегрессии является стационарным (в широком смысле), если все собственные значения матрицы A (включая комплексные) по модулю меньше единицы. Мат.ожидание \vec{\mu} стационарного процесса авторегрессии определяется как

\vec{\mu} = (I-A)^{-1}\vec{w},

где I — единичная матрица размера d\times d.

В терминах графических моделей авторегрессия первого порядка представляет собой байесовскую сеть с графом вида цепочка (см. рис.), где совместное распределение задается как

p(X|\vec{w},A,\Sigma,\vec{x}_0)=\prod_{n=1}^N\mathcal{N}(\vec{x}_n|\vec{w}+A\vec{x}_{n-1},\Sigma),

а \vec{x}_0 — начальная предыстория.

Авторегрессия M-го порядка задается как

\vec{x}_n = \vec{w}+\sum_{m=1}^MA_m\vec{x}_{n-m}+ \vec{\varepsilon}_n,\quad \vec{\varepsilon}_n\sim\mathcal{N}(\vec{0},\Sigma).

Здесь шумовые компоненты \vec{\varepsilon}_n по-прежнему предполагаются независимыми. Авторегрессия M-го порядка может быть сведена к авторегрессии первого порядка как

\tilde{\vec{x}}_n = \tilde{\vec{w}} + \tilde{A}\tilde{\vec{x}}_{n-1} + \tilde{\vec{\varepsilon}}_n,\quad \tilde{\vec{x}}_n = \begin{bmatrix}\vec{x}_n\\ \vec{x}_{n-1}\\ \vdots \\ \vec{x}_{n-M}\end{bmatrix},\quad \tilde{\vec{w}} = \begin{bmatrix}\vec{w}\\ 0\\ \vdots \\ 0\end{bmatrix},\quad \tilde{A} = \begin{bmatrix}A_1 & A_2 & A_3 & \dots & A_{M-1} & A_M\\ I & 0 & 0 & \dots & 0 & 0\\ 0 & I & 0 & \dots & 0 & 0\\ \dots \\ 0 & 0 & 0 & \dots & I & 0 \end{bmatrix},\quad \tilde{\vec{\varepsilon}}_n = \begin{bmatrix}\vec{\varepsilon}_n \\ 0 \\ \vdots \\ 0\end{bmatrix}.

Поэтому авторегрессия M-го порядка является стационарной, когда все собственные значения матрицы \tilde{A} по модулю меньше единицы. В частности, для случая d=1,M=1 условие стационарности эквивалентно |A_1|<1, а для случая d=1,M=2 — условию |A_1|<2,\ -1<A_2<1-|A_1|. Мат.ожидание стационарной регрессии M-го порядка определяется как

\vec{\mu} = (I-A_1-\dots-A_M)^{-1}\vec{w}.

В дальнейшем для удобства набор матриц A_1,\dots,A_M будем обозначать через \mathcal{A}.

Графическая модель авторегрессии 2-го порядка
Графическая модель авторегрессии 2-го порядка

В терминах графических моделей авторегрессия M-го порядка представляет собой байесовскую сеть с графом, показанном на рис. справа, где совместное распределение задается как

p(X|\vec{w},\mathcal{A},\Sigma,X_0)=\prod_{n=1}^N\mathcal{N}(\vec{x}_n|\vec{w}+\sum_{m=1}^MA_m\vec{x}_{n-m},\Sigma),

а X_0=\{\vec{x}_0,\vec{x}_{-1},\dots,\vec{x}_{1-M}\} — начальная предыстория.

Пример выборочной автокорреляционной функции с отсутствием значимых автокорреляций
Пример выборочной автокорреляционной функции с отсутствием значимых автокорреляций

Одним из способов определения адекватности моделирования данных с помощью модели авторегрессии является исследование остатков

\hat{\varepsilon}_n = \vec{x}_n - \hat{\vec{w}} - \sum_{m=1}^M\hat{A}_m\vec{x}_{n-m},

где \hat{\vec{w}},\hat{A} — оценки параметров авторегрессии (например, оценки максимального правдоподобия). Для успешного объяснения данных с помощью авторегрессии необходимо, чтобы остатки не были коррелированы по времени. Другими словами, выборочная автокорреляционная функция

ACF(\tau) = c_{\tau}/c_0,\quad c_{\tau} = \frac{1}{N-\tau}\sum_{n = \tau+1}^N(\varepsilon_n - \bar{\varepsilon})(\varepsilon_{n-\tau} - \bar{\varepsilon}),\quad \bar{\varepsilon} = \frac{1}{N}\sum_n\varepsilon_n

должна лежать в интервале \pm \frac{z_{1-\alpha/2}}{\sqrt{N}} для всех \tau. Здесь через z_{\beta} обозначена \beta-квантиль одномерного нормального распределения. Для уровня значимости \alpha=0.05 соответствующая квантиль равна 1.96.

Авторегрессионная скрытая марковская модель

Графическая модель авторегрессионной скрытой марковской модели 2-го порядка
Графическая модель авторегрессионной скрытой марковской модели 2-го порядка

Авторегрессионная скрытая марковская модель M-го порядка — это байесовская сеть, граф которой показан на рис. справа, а совместное распределение задается как

p(X,T|\Theta,X_0)=p(t_1)\prod_{n=2}^Np(t_n |t_{n-1})\prod_{n=1}^Np(\vec{x}_n |t_n,\vec{x}_{n-1},\dots,\vec{x}_{n-M}).

Здесь t_n\in\{1,\dots,K\} — скрытые дискретные состояния, \vec{x}_n\in\mathbb{R}^d — непрерывные наблюдаемые переменные. Априорное распределение p(t_1) задается вектором [\pi_1,\ldots,\pi_K], причем все \pi_k\ge 0 и \sum_k\pi_k=1. Распределение p(t_n |t_{n-1}) задается матрицей перехода R размера K\times K, где в ij-ой позиции стоит вероятность перехода из состояния i в состояние j. Все элементы этой матрицы неотрицательны, а сумма элементов по каждой строке равна единице. Модель генерации данных соответствует модели авторегрессии, в которой параметры \vec{w},\mathcal{A},\Sigma зависят от текущего состояния t_n. Таким образом,

p(\vec{x}_n|t_n,\vec{x}_{n-1},\dots,\vec{x}_{n-M})=\mathcal{N}(\vec{x}_n|\vec{w}_{t_n}+\sum_{m=1}^MA_{m,t_n}\vec{x}_{n-m},\Sigma_{t_n}).

В результате полный набор параметров модели \Theta состоит из \vec{\pi},R,\{\vec{w}_k,\mathcal{A}_k,\Sigma_k\}_{k=1}^K. Глубина авторегрессии M, количество скрытых состояний K, а также начальная предыстория X_0=\{\vec{x}_0,\vec{x}_{-1},\dots,\vec{x}_{1-M}\} задаются пользователем.

Формулировка задания

  1. Для модели авторегрессии M-го порядка:
    • Вывести формулы для оценки параметров модели \vec{w},\mathcal{A},\Sigma по наблюдениям \{\vec{x}_n\}_{n=1}^N с помощью метода максимального правдоподобия;
    • Реализовать процедуру генерации сигнала из модели авторегрессии;
    • Реализовать процедуру оценки параметров \vec{w},\mathcal{A},\Sigma по методу максимального правдоподобия;
  2. Провести эксперименты с авторегрессией M-го порядка:
    • Сгенерировать данные из модели авторегрессии, а затем восстановить параметры по методу максимального правдоподобия (рассмотреть различные значения параметров модели, а также различные размерности параметров). Как ведут себя значение правдоподобия, авторегрессионные остатки и восстановленные параметры при глубине авторегрессии меньше истинного значения, равного истинному значению и больше истинного значения? Какой объем данных необходим для адекватного восстановления параметров модели?
    • Сгенерировать данные из модели случайного процесса, отличного от авторегрессии. К чему приводит попытка объяснения таких данных с помощью авторегрессии?
  3. Для авторегрессионной скрытой марковской модели:
    • Вывести формулы ЕМ-алгоритма для оценки параметров модели \vec{\pi},R,\{\vec{w}_k,\mathcal{A}_k,\Sigma_k}_{k=1}^K, при этом предусмотреть ситуации, когда часть параметров задается пользователем;
    • Реализовать процедуру генерации сигнала из модели;
    • Реализовать процедуру вычисления маргинальных распределений для отдельных скрытых переменных t_n и пар соседних переменных t_{n-1},t_n при известных наблюдениях и параметрах модели с помощью алгоритма «вперёд-назад»;
    • Реализовать процедуру оценки параметров модели по методу максимального правдоподобия с помощью EM-алгоритма;
    • Реализовать процедуру поиска наиболее вероятной конфигурации скрытых переменных по наблюдаемым данным и параметрам модели с помощью алгоритма Витерби;
  4. Провести эксперименты с авторегрессионной скрытой марковской моделью:
    • Сгенерировать наблюдаемые и скрытые переменные из модели, а затем восстановить скрытые компоненты с помощью алгоритма Витерби при истинных параметрах модели, а также путем взятия аргмаксимумов для маргинальных распределений на t_n. Рассмотреть ситуации хорошо отделимых и слабо отделимых состояний, а также различные размерности параметров модели. Привести пример ситуации, когда алгоритм Витерби и аргмаксимумы маргиналов приводят к существенно различным конфигурациям.
    • Сгенерировать наблюдаемые и скрытые переменные из модели, а затем восстановить параметры модели только по наблюдаемым данным с помощью ЕМ-алгоритма. Рассмотреть различные ситуации. Имеет ли смысл в ЕМ-алгоритме задавать часть параметров модели вручную? Как параметры, задаваемые вручную, влияют на значение правдоподобия и на качество сегментации сигнала?
  5. [Бонус] Предложить свою схему сегментации подмножества сигналов, сгенерированных из авторегрессионной скрытой марковской модели, без использования модели авторегрессии.
  6. Составить отчёт в формате PDF с описанием всех проведённых исследований. Данный отчёт должен включать в себя вывод необходимых формул, различные графики с результатами экспериментов, а также развернутые комментарии к полученным результатам.

Рекомендации по выполнению задания

1. Вывод формул для авторегрессии и авторегрессионной скрытой марковской модели удобно осуществлять путем введения обозначений

\vec{y}_n = [\vec{x}_{n-1}^T\ \vec{x}_{n-2}^T\ \dots \vec{x}_{n-M}^T\ 1]^T,\quad B = [A_1\ A_2\ \dots A_M\ \vec{w}].

Тогда выражение \vec{x}_n - \vec{w} - \sum_{m=1}^MA_m\vec{x}_{n-m} можно лаконично записать как \vec{x}_n-B\vec{y}_n.

После вывода необходимых формул рекомендуется убедиться в том, что эти формулы переходят в стандартные формулы для оценки параметров многомерного нормального распределения (в том числе в рамках скрытой марковской модели) при обнулении всех A.

В случае вывода формул для \vec{w} при известном \mathcal{A} или, наоборот, формул для \mathcal{A} при фиксированном \vec{w} нотация через B,\vec{y}_n не подходит.

2. При тестировании ЕМ-алгоритма рекомендуется отслеживать монотонное возрастание логарифма неполного правдоподобия в итерациях. При этом вблизи локального максимума правдоподобия возможны небольшие нарушения монотонности из-за вычислительных погрешностей.

3. Обратите внимание, что для возможности реализации в сигналах сегментов типа k некоторой длины N_e необходимо, чтобы величина R_{kk}^{N_e} была существенно отлична от нуля.

Оформление задания

Выполненное задание следует отправить письмом по адресу bayesml@gmail.com с заголовком письма «[ГМ13] Задание 3 <ФИО>». Убедительная просьба присылать выполненное задание только один раз с окончательным вариантом. Также убедительная просьба строго придерживаться заданных ниже прототипов реализуемых функций.

Присланный вариант задания должен содержать в себе:

  • Файл отчёта в формате PDF с указанием ФИО;
  • Все исходные коды с необходимыми комментариями.

 

Генерация выборки из модели авторегрессии
X = ar_generate(N, w, A, Sigma, X0)
ВХОД
N — количество точек в генерируемой последовательности, число;
w — параметр сдвига, вектор длины d;
A — набор матриц в форме [A_1\ A_2\ \dots\ A_M], матрица размера d x Md;
Sigma — матрица ковариации для нормального шума, матрица размера d x d;
X0 — (необязательный параметр) начальная предыстория, матрица размера M x d;
ВЫХОД
X — сгенерированная последовательность, матрица размера N x d.

Если начальная предыстория X_0 не задана, то X_0 выбирается равной мат.ожиданию процесса авторегрессии.

Оценка параметров авторегрессии
[w, A, Sigma, res, logLH] = ar_fit(X, M)
ВХОД
X — наблюдаемая последовательность, матрица размера N x d, первые M строк соответствуют начальной предыстории;
M — глубина авторегрессии, число;
ВЫХОД
w — параметр сдвига авторегрессии, вектор длины d;
A — набор матриц в форме [A_1\ A_2\ \dots\ A_M], матрица размера d x Md;
Sigma — матрица ковариации нормального шума, матрица размера d x d;
res — остатки авторегрессии (набор векторов \vec{x}_n-\vec{w}-\sum_{m=1}^MA_m\vec{x}_{n-m}), матрица размера (N-M) x d;
logLH — логарифм правдоподобия настроенной модели авторегрессии, число.

 

Генерация выборки из авторегрессионной скрытой марковской модели
[X, T] = arhmm_generate(N, p, R, W, A, Sigmas, X0)
ВХОД
N — количество точек в генерируемой последовательности, число;
p — априорное распределение на t_1, вектор длины K;
R — матрица перехода размера K x K;
W — параметры сдвига авторегрессии для каждого состояния, матрица размера d x K;
A — авторегрессионные матрицы A для каждого состояния, массив размера d x Md x K;
Sigmas — матрицы ковариации шума для каждого состояния, массив размера d x d x K;
X0 — (необязательный параметр) начальная предыстория, матрица размера M x d;
ВЫХОД
X — сгенерированная наблюдаемая последовательность, матрица размера N x d;
T — сгенерированная последовательность состояний, вектор длины N.

Если начальная предыстория X_0 не задана, то X_0 выбирается равной мат.ожиданию процесса авторегрессии, соответствующего сгенерированному состоянию t_1.

Оценка маргиналов на скрытые переменные
[gamma, ksi, logLH] = arhmm_posterior(X, p, R, W, A, Sigmas)
ВХОД
X — наблюдаемая последовательность, матрица размера N x d, первые M строк соответствуют начальной предыстории;
p — априорное распределение на состояния, вектор длины K;
R — матрица перехода между состояниями, матрица размера K x K;
W — параметр сдвига авторегрессий, матрица размера d x K;
A — авторегрессионные матрицы, массив размера d x Md x K;
Sigmas — матрицы ковариации шумов, массив размера d x d x K;
ВЫХОД
gamma — вероятности вида p(t_n=k|X,\Theta), матрица размера K x (N-M);
ksi — вероятности вида p(t_{n-1}=k_1,t_n=k_2|X,\Theta), массив размера K x K x (N-M-1);
logLH — логарифм неполного правдоподобия, число.

 

Оценка параметров авторегрессионной скрытой марковской модели с помощью ЕМ-алгоритма
[p, R, W, A, Sigmas, logLH] = arhmm_fit(X, K, M, param_name1, param_value1, ...)
ВХОД
X — наблюдаемая последовательность, матрица размера N x d, первые M строк соответствуют начальной предыстории;
K — количество скрытых состояний, число;
M — глубина авторегрессии, число;
(param_name, param_value) — набор необязательных параметров, следующие имена и значения возможны:
'max_iter' — максимальное число итераций ЕМ-алгоритма, по умолчанию = 100;
'num_start' — количество запусков из случайных начальных приближений, по умолчанию = 10;
'tol_LH' — точность оптимизации по значению логарифма правдоподобия, по умолчанию = 1e-4;
'p' — задаваемое пользователем априорное распределение на состояния (в случае задания не оптимизируется ЕМ-алгоритмом), по умолчанию = [];
'R' — задаваемая пользователем матрица перехода между состояниями, по умолчанию = [];
'W' — задаваемый пользователем набор параметров сдвига, по умолчанию = [];
'A' — задаваемый пользователем набор авторегрессионных матриц, по умолчанию = [];
'Sigmas' — задаваемый пользователем набор матриц ковариации шума, по умолчанию = [];
'display' — режим отображения, true или false, если true, то отображается текущая информация, например, номер запуска, номер итерации, текущее значение правдоподобия и т.д.
ВЫХОД
p — априорное распределение на состояния, вектор длины K;
R — матрица перехода между состояниями, матрица размера K x K;
W — параметр сдвига авторегрессий, матрица размера d x K;
A — авторегрессионные матрицы, массив размера d x Md x K;
Sigmas — матрицы ковариации шумов, массив размера d x d x K;
logLH — логарифм неполного правдоподобия, число.

 

Сегментация выборки с помощью алгоритма Витерби
[T, logLH] = arhmm_segment(X, p, R, W, A, Sigmas)
ВХОД
X — наблюдаемая последовательность, матрица размера N x d, первые M строк соответствуют начальной предыстории;
p — априорное распределение на t_1, вектор длины K;
R — матрица перехода размера K x K;
W — параметры сдвига авторегрессии для каждого состояния, матрица размера d x K;
A — авторегрессионные матрицы A для каждого состояния, массив размера d x Md x K;
Sigmas — матрицы ковариации шума для каждого состояния, массив размера d x d x K;
ВЫХОД
T — номера состояний в каждый момент времени, вектор длины N-M;
logLH — логарифм полного правдоподобия для найденного T, число.
Личные инструменты